本发明涉及一种使用尿素纯化藻油中的GLA的方法，包括以下步骤：S1：使用所述藻油制备游离脂肪酸样品；S2：将所述游离脂肪酸样品加入尿素溶液中于0‑4℃下进行第一包合反应，过滤，去除滤渣，用石油醚从滤液中萃取脂肪酸，得到不饱和脂肪酸样品；S3：将所述不饱和脂肪酸样品加入尿素溶液中于‑40‑‑30℃下进行第二包合反应，过滤，收集滤渣；S4：从所述滤渣中提取GLA。通过使用本发明的双重尿素包合法，可从原来GLA仅占15％油脂中提取纯度高达95％以上的GLA，实现了在低成本的条件下获得高纯度的GLA的目的。